通过改变外源cDNA在质粒中的插入方向或选用不同的RNA聚合酶，可以控制RNA的转录方向(即以cDNA的哪条链为模板转录RNA)，从而可以得到与mRNA同序列的同义RNA探针(senseprobe)或与mRNA互补的反义RNA探针(antlsense probe)，后者即互补RNA(cRNA)探针。通常用同义RNA探针作cRNA探针的阴性对照。ELISA试剂盒
 
    由于在体外转录反应物中可提供有标记物标记的核苷酸为原料．因此经过体外转录就能得到标记的cRNA探针。ceRNA探针是单链探针，故以cRNA探针进行杂交反应可避免应用双链cDNA探针作杂交反应时存在的两条链之间的复性问题。cRNA和mRNA之间形成的杂交体要比cDNA-mRNA杂交体稳定．因此杂交反应后可经受高严格度洗涤。cRNA -mRNA杂交体不受RNA酶的影响，故杂交后还可用RNA酶处理，以除去未结合的探针。此外，体外转录合成的cRNA探针的长度比较一致。ELISA试剂盒

    由于cRNA探针具有以上优点，因此在分子杂交中，特别是在原位杂交中的应用较广泛。但cRNA探针的制备过程较复杂，需要较高的分子生物学实验条件，cRNA对RNA酶敏感，易被RNA酶破坏，因而在操作过程中需严格防止RNA酶污染。ELISA试剂盒